吡唑类化合物是一类具有重要药物骨架结构的化合物,但在DNA编码化合物库中合成On-DNA吡唑化合物的方法尚未见报道.为了增加DNA编码化合物库的多样性,提升其应用价值,开发一种适用于多孔板操作的大批量On-DNA吡唑化合物合成方法变得尤为重要.
本文所述的方法以On-DNA肼类化合物和1,3二羰基类化合物为原料,通过反应得到On-DNA吡唑化合物.On-DNA肼类化合物的结构式为DNA与R1通过一个或多个化学键连接,而1,3二羰基类化合物的结构式为R',R2,R3分别代表不同的取代基.On-DNA产物的结构式中,DNA包含由人工修饰或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链核苷酸链,并通过一个或多个化学键与R1相连.DNA的长度为10~200bp.
在实际操作中,On-DNA肼类化合物与1,3二羰基类化合物在特定的溶剂和缓冲体系中反应,生成On-DNA吡唑化合物.反应条件包括温度,pH值及反应时间等,均为温和条件,适合大规模生产.
反应在溶剂中进行,溶剂可以是水,甲醇,乙醇,乙腈,二甲亚砜或无机盐缓冲液等,也可以是这些溶剂的混合体系.优选的反应溶剂包含2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)缓冲液或磷酸氢二钠/磷酸二氢钠(PBS)缓冲溶液,pH值控制在5.5~9.4之间,最佳pH值为5.5.反应温度范围为0℃~100℃,具体可选择20℃,30℃,40℃,50℃,60℃,70℃或80℃.反应时间为0.5~24小时,可根据实际需要调整.
在反应中,On-DNA肼类化合物与1,3二羰基类化合物的摩尔当量比为1:10~1000,优选1:50~1000,最佳比例为1:100.这种比例设置既能保证反应的高效性,又能避免原料的浪费.