ANTI-SF1
ANTI-SF1是一类可以特异性结合SF1的多克隆抗体,主要用于检测SF1的Western Blot,IHC-P,IF,ELISA,Co-IP等多种免疫学实验. 检测原理:双抗体夹心法测定标本中SF1水平.用纯化的SF1抗体包被微孔板,制成固相抗体,往包被单抗的微孔中依次加入SF1,再与HRP标记的SF1抗体结合,形成抗体-抗原-酶标抗体复合物,经过彻底洗涤后加底物TMB显色.TMB在HRP酶的催化下转化成蓝色,并在酸的作用下转化成最终的黄色.颜色的深浅和样品中的SF1呈正相关.用酶标仪在450nm波长下测定吸光度(OD值),通过标准曲线计算样品中SF1浓度.
📌 参考资料/链接：
Lipopeptide surfactants:Production,recovery and pore forming capacity[J].Mnif Inès,Ghribi Dhouha.Peptides.2015
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用于胡麻枯萎病生防菌SF1生防功能基因的预测研究
以实验室分离得到的萎缩芽孢杆菌SF1为研究对象,首先,对菌株SF1的生长特性进行了测定;其次,测定了菌株SF1对不同省份分离的胡麻枯萎病病原菌的抑制效果;最后,对菌株SF1的全基因组序列进行了测定和解析,从中筛选潜在的生防基因.
结果...1,绘制了菌株SF1的种子生长曲线和发酵生长曲线.确定种子培养条件为:温度37℃,150r/min振荡培养11h;发酵培养条件为:接种量1%,温度32℃,150r/min振荡培养24h.
2,经Illumina MiSeq测序平台对菌株SF1的全基因组序列进行测定和解析.结果显示菌株SF1基因组大小为4,143,714bp,编码蛋白质的序列有3,615,237bp,占全部基因组的87.2%.克隆获得了β-1,3-葡聚糖酶基因.基因全长1086bp,与Bacillus atrophaeus UCMB-5137的yhfE基因相似性为95%,证明全基因组测序结果真实可靠.
3,经蛋白比对注释,SF1基因组中含有多种抗生素的基因簇,包括核糖体合成的细菌素(枯草杆菌蛋白酶subtilosin,抗霉枯草菌素mycosubtilin和表皮菌素epidermin等)和抗菌酶类(几丁质酶Chitinase,β-1,3-葡聚糖酶β-1,3-glucanase和蛋白酶protease等).
同时也包含有非核糖体合成的抗菌脂肽类物质(表面活性素surfactin和丰原素fengycin)和菌溶素(bacilysin);还发现在非核糖体合成途径中催化合成聚酮类抗生素bacillaene的基因簇PKS,催化磷脂类抗生素bacilys℃in的基因ytpA.同时还发现有儿茶酚型嗜铁素铁载体(siderophore bacillibactin)以及与swarming定植密切相关的5个基因,分别为swrA,flgB,efp,srfA和cheB等.
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