50×TAE 缓冲液
50×TAE缓冲液是分子生物学实验中常用的核酸电泳缓冲液,特别是在DNA或RNA的琼脂糖凝胶电泳中发挥着重要作用.50×TAE缓冲液是一种常用于核酸电泳的缓冲系统,由Tris-acetate和EDTA组成.TAE的全称为四羟乙基胺四乙酸,其化学名称为N-[2-羟基-1,2-乙二胺基]-三乙酸,纯化和检测过程中的电泳分离. 在DNA提取过程中,TAE缓冲液可以有效地稳定DNA,防止其降解.同时,由于其较低的离子强度和较高的pH值(约为8.3),TAE缓冲液可以有效地抑制DNA酶的活性,从而保护DNA免受降解.此外,TAE缓冲液还常用于RNA的提取和纯化过程中的电泳分离.
📌 参考资料/链接:
Adaptation to HLA-ass℃iated immune pressure over the course of HIV infection and in circulating HIV-1 strains.[J].Alves Eric;AlKaabi Marwah;Keane Niamh M;Leary Shay;Almeida CoralAnn M;Deshpande Pooja;Currenti Jennifer;Chopra Abha;Smith Rita;Castley Alison;Mallal Simon;Kalams Spyros A;Gaudieri Silvana;John Mina.PLoS pathogens,2022
📄 详细内容
50×TAE缓冲液可以用于HIV-1新重组株CRF55_01B的T细胞表位变异特征研究
研究通过横断面分析比较CRF55_01B与当前主要流行的CRF01_AE,B,CRF07_BC亚型毒株在病毒Gag,Pol,Nef蛋白的T细胞表位的变异,尤其是已知具有明确保护作用的HLA限制性T细胞表位的变异情况,分析氨基酸变异对病毒复制能力的影响,并明确CRF55_01B亚型病毒二代重组断点与氨基酸多态性及T细胞应答的关系,以此解析CRF55_01B亚型病毒的生物学特点,并为疾病进展评价及免疫治疗奠定基础.
研究方法:1.研究对象本研究选取深圳市2015-2020年基因型耐药检测确定为CRF01_AE,CRF07_BC,CRF55_01B和B亚型病毒的新诊断199例HIV感染者,经Western Blot确认HIV感染,纳入研究时未服用过抗逆转录病毒药物,通过亲和力实验判定为近期感染(6个月内).收集感染者血浆标本,血浆-80℃冷冻.本项目招募的所有参与者均获得书面知情同意书.2.血浆HIV-RNA提取和gag,pol,nef全长基因巢式PCR扩增根据QIAamp Viral RNAMini Kit试剂盒的说明书从血浆中提取HIV-RNA.采用自行设计引物巢式PCR扩增方法进行gag,pol,nef基因片段扩增.3.PCR产物的鉴定及测序使用50×TAE缓冲液配制1.0%琼脂糖凝胶,根据gag,pol,nef基因片段大小选择2000bp,10000bp DNA ladder作为定量Marker,每孔加5µl的第二轮PCR产物,120V的电压下电泳30 min.在Ultra-Violet Product凝胶分析系统紫外模式下观察有无目的条带.获得目的条带的PCR产物由华大基因公司(中国)直接测序.
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