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可见光促进的DNA编码砜类化合物的合成方法

背景与意义组合化学利用“组合-拆分”策略快速构建化合物库,但化合物结构的识别制约着该方法的发展.1992年,DNA编码化合物库的概念提出,该技术利用DNA的相对稳定性及可检测性,使每个化合物在分子水平上连接有一段特异的DNA片段来记录化合物结构相关信息,极大降低了传统化合物存储所需的硬件条件,增大了化合物的容量.然而,DNA兼容的化学方法的发展仍然是制约该技术的瓶颈.由于DNA必须在水相中才能稳定存在,对pH,温度,金属离子,氧化还原试剂等都比较敏感,同时DNA编码原料浓度极低,造成on-DNA兼容化学反应类型不足,化合物结构覆盖率低.因此,解决DNA水溶性及浓度低带来的反应活性不足的问题,发展条件温和,种类多样的on-DNA兼容化学反应具有应用前景.
📌 参考资料/链接:
《March's Advanced Organic Chemistry》 (Michael B. Smith, Wiley)

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可见光促进的自由基反应

光促进的自由基反应具有条件极为温和,低浓度下反应活性高的特点,不少研究团队也尝试采用此类反应来发展DNA编码化合物库的构建反应.2011年,LIu小组首次报道了金属Ru作为光催化剂,可见光促进的叠氮化合物还原为胺的反应.随后,多个研究团队及公司发展了多种可见光促进的自由基反应.

本项目提供一种有机溶剂反应条件下的,可见光促进的,基于电子给受体复合物转电子的自由基偶联反应来构建DNA编码化合物库的方法.该方法采用离子交换树脂固载DNA编码卤代芳烃,在有机溶剂中,加入碱,在一定波长光的促进下完成亚磺酸钠的on-DNA自由基偶联反应,构建DNA编码砜类化合物.


合成方法详解

具体的技术方案如下:将结构为式(I)的DNA编码卤代芳烃化合物固载在树脂上,有机溶剂洗涤;将固载的DNA编码卤代芳烃化合物,结构为式(II)的亚磺酸钠,碱溶于有机溶剂中,在一定波长的光照射下,于0-80℃下反应5-24小时,除掉反应溶剂,洗涤多次;加入Elutebuffer将结构为式(III)的DNA编码砜类化合物洗脱,沉淀并离心产物,获得结构为式(III)的DNA编码砜类化合物.

所述的DNA编码卤代芳烃化合物式(I)为含有一段DNA序列的胺类化合物与含有羧基的卤代芳烃通过酰胺键进行连接所得到的DNA编码化合物;所述DNA是经由人工修饰的/未修饰的核苷酸单体聚合得到的双链核苷酸序列.



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